Федерация фехтования Азербайджана была создана 28 апреля 1992 года. В мае 1992 года AQF была избрана членом Международной федерации фехтования.
20 сентября 2017 года состоялась внеочередная отчетно-выборная конференция Федерации фехтования Азербайджана. На конференции, прошедшей в административном здании Национального олимпийского комитета, президентом организации был избран Микаил Джаббаров. 20 ноября 2021 года на общем собрании, состоявшемся в административном здании Министерства молодежи и спорта, Балакиши Гасымов был избран президентом Федерации фехтования Азербайджана.
Вице-президентами федерации являются Фикрет Зейналов и Фархад Касимов, а генеральным секретарем - Васиф Мамедов.
Главный тренер национальной сборной по фехтованию – Чингиз Мустафаев.
